Gracias a Serebii, finalmente entendemos más como funcionará la compatibilidad entre Pokémon Rubí Omega / Zafiro Alfa y Pokémon X / Y. Anteriormente desde Game Freak habían dicho que aunque estas dos series de juegos serían compatibles, no habría ningún parche para soportar las nuevas megaevoluciones en X / Y. Desde estas afirmaciones ha habido una gran confusión de como funcionará exactamente esta compatibilidad, pero parece que hoy finalmente ya podemos entenderla más a fondo.
Batallas
Las batallas en línea e inalámbricas funcionarán de la siguiente manera: cuando estés batallando con otro jugador que también esté utilizando Pokémon Rubí Omega / Zafiro Alfa no habrá ningún tipo de restricciones; podrás usar cualquiera de las nuevas megaevoluciones, ataques u objetos introducidos en los remakes.
Sin embargo, cuando estés batallando contra alguien que esté usando Pokémon X o Pokémon Y habrán varias restricciones: no podrás usar ninguna de las nuevas megaevoluciones introducidas en Rubí Omega / Zafiro Alfa, ni tampoco ningún nuevo objeto, ataque o habilidad.
Además, en el Área de Combate las reglas son diferentes. En Rubí Omega y Zafiro Alfa tanto Combate Libre Amistoso como para Combates por Puntos estarán completamente separados de los de X / Y, por lo que no podremos jugar en este modo entre las dos series de juegos. Además, en Combates por Puntos las reglas serán diferentes dependiendo del juego:
- Liga RΩ/Zα: Solo disponible para jugadores de Pokémon Rubí Omega y Zafiro Alfa. Solo permite usar Pokémon capturados, nacidos u oficialmente repartidos en Pokémon Rubí Omega, Zafiro Alfa, X o Y.
- Liga X/Y: Solo disponible para jugadores de Pokémon X y Y. En esta liga se permite usar a cualquier Pokémon, incluyendo aquellos transferidos desde Blanco, Negro, Blanco 2 o Negro 2.
Intercambios

Al intercambiar entre copias Rubí Omega y Zafiro Alfa se podrá realizar sin muchas restricciones, solo con algunos objetos especiales no intercambiables (como por ejemplo el Cupón de Descuento, que en X/Y no se podía intercambiar).
Sin embargo al intercambiar entre Rubí Omega / Zafiro Alfa y X/Y aplicarán unas restricciones parecidas a las de las batallas: no se podrá intercambiar ningún Pokémon que lleve consigo un nuevo objeto introducido en los remakes o que haya aprendido uno de los nuevos movimientos.
Hasta este momento, se desconoce como funcionarán las otras características del PSS como el Intercambio prodigioso y el GTS; si tendrán servidores separados o tendrán restricciones como en los intercambios.
Banco Pokémon

Como ya sabemos, el Banco Pokémon remueve los objetos de todos los Pokémon antes de almacenarlos, por lo que no habrá problema con los nuevos objetos y megaevoluciones introducidas en Rubí Omega / Zafiro Alfa.
Sin embargo, todavía se desconoce que pasará con los Pokémon que tengan aprendido alguno de los nuevos movimientos; si no podrá importarse de vuelta en X/Y o si simplemente no se podrá depositar en el Banco.